Ali Masoudi-Nejad

Professor

Update: 2026-09-23

Ali Masoudi-Nejad

دانشکده‌ علوم پایه مهندسی / گروه آموزشی الگوریتم ها و محاسبات

P.H.D dissertations

  1. پیش بینی هم افزایی ترکیبات دارویی مبتنی بر ویژگی های پاسخ سلولی با استفاده از شبکه های عصبی عمیق
    مریم مهربانی 2026
  2. پلتفرم مبتنی بر یادگیری عمیق جهت شناسایی نشانگرهای زیستی مرتبط با بقا و زیر نوع سرطان بر اساس داده های مولتی امیک در بیماری سرطان آندومتریال رحم
    بهناز حاجی ملاحسینی 2026
  3. ترسیم و آنالیز شبکه هم وقوعی در میکروبیوم تنفسی بیماریهای مزمن ریوی
    آزاده کاویان فر 2024
  4. آنالیز میکروبیوم تنفسی در بیماری های مزمن ریوی با استفاده از شبکه های متابولیکی
    حمیدرضا طاهرخانی 2024
  5. آنالیز و مقایسه شبکه های برهمکش RNA در زیرگروه های سرطان پستان
    علیرضا شریعت مدارطالقانی 2024
  6. بررسی مکانیسم های ملکولی مشترک اختلال افسردگی شدید و بیماری آلزایمر با استفاده از رویکرد سیستم بیولوژی
    صابر رستاد 2024
  7. تجمیع داده های امیک جهت شناسایی گروههای مرتبط با بقا در سرطان روده با استفاده از متد مبتنی بر یادگیری عمیق
    سیامک سلیمی 2024
  8. ریوایرینگ شبکه های دوبخشی هم بیانی miRNA-mRNA در سرطان
    محمدمهدی نقی زاده جهرمی 2023
  9. یکپارچه سازی داده های متیلاسیون DNA و تغییرات تعداد کپی با بیان ژن جهت تحلیل ساختار تنظیمی اپی ژنتیک در سرطان سلول های سنگفرشی
    وحید غفارپور 2023
  10. آنالیز محاسباتی و یکپارچه سازی داده های چندگانه امیکی در پن کنسر
    سید سجاد مروجی 2022
  11. ارزیابی پیشرفت تومور و ایجاد متاستاز در سطح ترنسکریپتوم براساس رویکرد زیست سامانه ای
    سمانه خوش بخت 2022
  12. مقایسه مکانیزم بیماری های COPD و سرطان ریه به منظور شناسایی بیومارکرهای miRNA با استفاده از بازسازی شبکه های mRNA-miRNA
    امیرحسین فتحی نوید 2022
  13. بازساری شبکه ژنی مغز انسان با استفاده از شبکه عملکردی و شبکه میانکنش پروتئین-پروتئین در بیماران مبتلا به تومور مغزی
    فائزه متقی طلب 2021
  14. تلفیق دو عامل بیولوژیک (. Trichogramma sp و Habrobracon hebetor) و اسانس آنغوزه در کنترل کرم گلوگاه انار Ectomyelois ceratoniae در شرایط طبیعی
    کبری فـتوحی 2021
  15. پیش بینی ویژگی های ترکیب های دارویی با استفاده از یادگیری چند وظیفه ای و انتقالی
    کریم عباسی 2021
  16. کنترل پذیری هدفی در شبکه های بیولوژیکی پیچیده مطالعه نظری
    علی ابراهیمی 2021
  17. کاربرد مجدد داروها با استفاده از یادگیری ماشین و مجتمع سازی داده ها از منابع مختلف
    سیدعقیل هوشمند 2020
  18. طراحی توالی آپتامری اختصاصی برای بیومارکر سرطانی با استفاده از روش های یادگیری ماشین
    مهسا ترکمانیان افشار 2020
  19. شناسایی مولفه های عملکردی در بیماری سرطان با استفاده از شبکه های چند لایه رویکرد بیولوژی سیستمی ترکیبی
    احسان پرنور 2020
  20. تجمیع شبکه های مبتنی بر داده های زیستی برای یافتن ماژول های سرطانی با استفاده از رویکرد سیستم بیولوژی
    نیلوفر حق جو 2020
  21. بررسی تولید نایسین و رشد در Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 با رویکرد سامانه ای
    نغمه پورین محمد 2020
  22. بررسی شبکه هم بیانی ژنی در بیماری های مزمن ریوی با رویکرد سیستم بیولوژی
    مظاهر مقصودلو 2020
  23. استنباط عملكرد هدف گذاري مجدد دارو با استفاده از مطالعات وابستگي سطح فنوم
    علی خسروی 2019
  24. مطالعه بیماری اندومتریوز بر اساس تجمیع داده های متیلوم و میکرواری با استفاده از رویکردسیستم بیولوژی
    نادیا برجسته 2019
  25. هدف يابي مجدد داروها مبتني بر پيش بيني تعاملات دارو-هدف با استفاده از روش هاي داده كاوي
    یوسف مسعودی سبحان زاده 2019
  26. بررسي شبكه ي RNA هاي رقابتي درونزاد در سرطان دستگاه ادراري با رويكرد سيستم بيولوژي
    مرتضی پیاده کوهسار 2019
  27. بازسازي شبكه تنظيم ژني بيوسنتز چربي با استفاده از الگوهاي اپي ژنتيكي: با رويكرد سيستم بيولوژي
    داریوش سلیمی 2019
  28. مطالعه علل ژنتيكي و راهكارهاي درماني بيماري هاي سيستم عصبي با استفاده از تحليل ارتباط ژنوم و آناليز ادغامي
    زهرا مرتضائی 2019
  29. تحليل در مقياس ژنومي تغييرات بحراني دي ان اي و اثر آن بر تكامل ژنوم: ديدگاه نظريه كدگذاري
    حسین لنجانیان 2019
  30. اولويت بندي ژن هاي كانديد در بيماري ها با رويكرد مبتني بر شبكه هاي پيچيده
    علیرضا مشکین 2018
  31. بررسي نقش long non-coding RNA ها در سرطان هاي انساني با استفاده از بازسازي شبكه هاي هم بياني ژن هاي كد كننده -غير كد كننده
    شروین علایی 2018
  32. الگوريتم هاي مختلف يافتن موتيف در شبكه هاي زيست شناسي
    زهرا رزاقی مقدم کاشانی 2018
  33. بازسازي وآناليز شبكه برهمكنشي دو بخشي miRNA و mRNA در مراحل مختلف سرطان روده بزرگ با رويكرد سيستم بيولوژي
    حبیب مطیع قادر 2018
  34. مدلسازي مسيرهاي متابوليكي سيانوباكتر با استفاده از رويكرد سيستم بيولوزي و سنتتيك بيولوژي به منظور توليد سوخت زيستي
    رضا محمدی 2018
  35. آناليز مقايسه اي در مقياس ژنومي شبكه تظاهر ژني سه ارگانيسم ساكن در ريه بيماران سيستيك فايبروزيس با استفاده از روش هاي سيستم بيولوژي
    نازنین حسین خان 2018
  36. بهبود و پيشگويي ارتباطات در شبكه هاي زيستي با رويكردهاي مبتني بر پيشگويي پيوند
    صادق سلیمانی 2018
  37. استنتاج ساختار شبكه هاي تنظيم ژني با استفاده از روشهاي يادگيري ماشين
    زهرا نریمانی 2018
  38. مطالعه پاسخ دهي به درمان در سرطان با رويكرد سيستم بيولوژي
    زینب السادات موسویان حر 2018
  39. بررسي تجربي و نظري اثر گلوكز و بوسوليك اسيد بر روي مغز ديابتي موش در شرايط invivo,exvivo
    مرضیه دهقان شاسلطنه 2018
  40. مدل سازي شبكه هاي متابوليك مخمر بر مبناي داده هاي اپي ژنيك
    علی صالح زاده یزدی 2018
  41. بازسازي و شبيه سازي مسير هاي مولكولي برهمكنشي در تغيير راه هوايي ريه با رويكرد سيستم بيولوژي
    علی نجفی 2018
  42. پيشگويي شبكه بر هم كنش پروتئين ها به وسيله تركيب طبقه بندها
    جواد ظهیری 2018
  43. مدلسازي بيماري سرطان بعنوان يك بيماري متابوليكي
    یزدان عسگری 2018
  44. مدلسازي ديناميك شبكه هاي پيام رساني سلول با رويكرد سيستم بيولوژي
    ایثار نصیری 2018
  45. مطالعه ژيشروي تومور با استفاده از سيستم بيولوزي
    غلامرضا بیدخوری 2018
  46. ريز ريخت شناسي جنس افرا در ايران و كاربرد پردازش تصوير در تاكسونومي اين جنس
    مژگان سادات محتشمیان 2018
  47. ارائه نقشه ساختار -عملكرد مغز براساس رويكرد تبادل اطلاعات در بين شبكه ها : از ارتباطات تا شناخت
    حسین صیدخانی 2018
  48. مطالعه فيزيولوژيكي بيوشيميايي و ژنوميكي برخي آنزيمهاي مسير بيوسنتزي تركيبات فنلي و اثر آنها در ريشه زايي برخي ارقام گردو
    منیره چنیانی 2018

Master Theses

  1. بازنشانی و تحلیل مدل شبکه متابولیک دودمان های عامل و خاطره از لنفوسیت T و بهینه سازی رشد و تمایز آن ها
    سروش ستاره 2024
  2. بررسي تاثير استفاده از معيارهاي مركزيت در خوشه بندي شبكه هاي زيستي
    مهدیه السادات قاسمی بنادکوکی 2023
  3. تاثيرات ژنتيكي بر الگوي QEEGو كاربردهاي آن در درمان هاي مبتني بر نوروفيدبك
    محمد علمی 2023
  4. اثرات میکروبیوم معده بر ایجاد و یا افزایش وخامت سرطان معده
    هانا کامل زین الدین 2023
  5. تشخيص زير شبكه هاي نشان گر بيماري در شبكه هاي بر همكنش پروتئين
    احسان حیدری 2022
  6. پيش بيني اثرات بيولوژيكي نانو ذرات با استفاده از روش هاي يادگيري ماشين و خواص آنها
    آزیتا طاهری 2018
  7. تجزيه بيوانفورماتيك خانواده ژني3-هيدروكسي3متيلگلوتاريل-كوآنزيمA ردوكتاز
    مریم دارابی 2018
  8. بررسي فيلوژني ژن ACC در گندميان (Triticeae
    یوسف دهقانی محمدی 2018
  9. نظريه شبكه ها والگوريتم آشكار سازي موتيف از شبكه
    سعید امیدی کلیشمی 2018
  10. شناسايي عناصرجابجا شونده
    نیلوفر آقائی ابیانه 2018
  11. ساده سازي شبكه هاي تنظيمي ژني
    مهدی رحیمی 2018
  12. ارائه روشی برای کشف موتیف در شبکه های وزن دار
    عبدالحسین حبـیب زاده اردبیـلی 2018
  13. الگوريتم موازي براي تشخيص رشته هاي تكراري
    میثم باستانی 2018
  14. پيداكردن موتيف شبكه در شبكه هاي بزرگ زيستي بوسيله رايانش ابري
    ایمان شرف الدین 2018
  15. تجزيه و تحليل و استنباط شبكه هاي ژني با تظاهر توام در خانواده ژني GLK با استفاده از داده هاي ريزآرايه
    امید کلاهیان بناب 2018
  16. پيداكردن زير گرافهاي چگال در شبكه بر هم كنش ميان پروتئينها توسط محاسبات نرم
    حمید روائی بازافتی 2018
  17. تحليل شبكه تنظيم رونويسي تغييرات پس از ترجمه بر روي هيستون ها در اپيژنيك محاسباتي
    هادی جرجانی 2018