رساله های دکتری

1. پیش بینی هم افزایی ترکیبات دارویی مبتنی بر ویژگی های پاسخ سلولی با استفاده از شبکه های عصبی عمیق
   مریم مهربانی 1404
2. پلتفرم مبتنی بر یادگیری عمیق جهت شناسایی نشانگرهای زیستی مرتبط با بقا و زیر نوع سرطان بر اساس داده های مولتی امیک در بیماری سرطان آندومتریال رحم
   بهناز حاجی ملاحسینی 1404
3. ترسیم و آنالیز شبکه هم وقوعی در میکروبیوم تنفسی بیماریهای مزمن ریوی
   آزاده کاویان فر 1403
4. آنالیز میکروبیوم تنفسی در بیماری های مزمن ریوی با استفاده از شبکه های متابولیکی
   حمیدرضا طاهرخانی 1403
5. آنالیز و مقایسه شبکه های برهمکش RNA در زیرگروه های سرطان پستان
   علیرضا شریعت مدارطالقانی 1403
6. بررسی مکانیسم های ملکولی مشترک اختلال افسردگی شدید و بیماری آلزایمر با استفاده از رویکرد سیستم بیولوژی
   صابر رستاد 1402
7. تجمیع داده های امیک جهت شناسایی گروههای مرتبط با بقا در سرطان روده با استفاده از متد مبتنی بر یادگیری عمیق
   سیامک سلیمی 1402
8. ریوایرینگ شبکه های دوبخشی هم بیانی miRNA-mRNA در سرطان
   محمدمهدی نقی زاده جهرمی 1402
9. یکپارچه سازی داده های متیلاسیون DNA و تغییرات تعداد کپی با بیان ژن جهت تحلیل ساختار تنظیمی اپی ژنتیک در سرطان سلول های سنگفرشی
   وحید غفارپور 1401
10. آنالیز محاسباتی و یکپارچه سازی داده های چندگانه امیکی در پن کنسر
    سید سجاد مروجی 1401
11. ارزیابی پیشرفت تومور و ایجاد متاستاز در سطح ترنسکریپتوم براساس رویکرد زیست سامانه ای
    سمانه خوش بخت 1401
12. مقایسه مکانیزم بیماری های COPD و سرطان ریه به منظور شناسایی بیومارکرهای miRNA با استفاده از بازسازی شبکه های mRNA-miRNA
    امیرحسین فتحی نوید 1400
13. بازساری شبکه ژنی مغز انسان با استفاده از شبکه عملکردی و شبکه میانکنش پروتئین-پروتئین در بیماران مبتلا به تومور مغزی
    فائزه متقی طلب 1400
14. تلفیق دو عامل بیولوژیک (. Trichogramma sp و Habrobracon hebetor) و اسانس آنغوزه در کنترل کرم گلوگاه انار Ectomyelois ceratoniae در شرایط طبیعی
    کبری فـتوحی 1400
15. پیش بینی ویژگی های ترکیب های دارویی با استفاده از یادگیری چند وظیفه ای و انتقالی
    کریم عباسی 1400
16. کنترل پذیری هدفی در شبکه های بیولوژیکی پیچیده مطالعه نظری
    علی ابراهیمی 1400
17. کاربرد مجدد داروها با استفاده از یادگیری ماشین و مجتمع سازی داده ها از منابع مختلف
    سیدعقیل هوشمند 1399
18. طراحی توالی آپتامری اختصاصی برای بیومارکر سرطانی با استفاده از روش های یادگیری ماشین
    مهسا ترکمانیان افشار 1399
19. شناسایی مولفه های عملکردی در بیماری سرطان با استفاده از شبکه های چند لایه رویکرد بیولوژی سیستمی ترکیبی
    احسان پرنور 1399
20. تجمیع شبکه های مبتنی بر داده های زیستی برای یافتن ماژول های سرطانی با استفاده از رویکرد سیستم بیولوژی
    نیلوفر حق جو 1399
21. بررسی تولید نایسین و رشد در Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 با رویکرد سامانه ای
    نغمه پورین محمد 1399
22. بررسی شبکه هم بیانی ژنی در بیماری های مزمن ریوی با رویکرد سیستم بیولوژی
    مظاهر مقصودلو 1398
23. استنباط عملکرد هدف گذاری مجدد دارو با استفاده از مطالعات وابستگی سطح فنوم
    علی خسروی 1398
24. مطالعه بیماری اندومتریوز بر اساس تجمیع داده های متیلوم و میکرواری با استفاده از رویکردسیستم بیولوژی
    نادیا برجسته 1398
25. هدف یابی مجدد داروها مبتنی بر پیش بینی تعاملات دارو-هدف با استفاده از روش های داده کاوی
    یوسف مسعودی سبحان زاده 1398
26. بررسی شبکه ی RNA های رقابتی درونزاد در سرطان دستگاه ادراری با رویکرد سیستم بیولوژی
    مرتضی پیاده کوهسار 1398
27. بازسازی شبکه تنظیم ژنی بیوسنتز چربی با استفاده از الگوهای اپی ژنتیکی: با رویکرد سیستم بیولوژی
    داریوش سلیمی 1397
28. مطالعه علل ژنتیکی و راهکارهای درمانی بیماری های سیستم عصبی با استفاده از تحلیل ارتباط ژنوم و آنالیز ادغامی
    زهرا مرتضائی 1397
29. تحلیل در مقیاس ژنومی تغییرات بحرانی دی ان ای و اثر آن بر تکامل ژنوم: دیدگاه نظریه کدگذاری
    حسین لنجانیان 1397
30. اولویت بندی ژن های کاندید در بیماری ها با رویکرد مبتنی بر شبکه های پیچیده
    علیرضا مشکین 1397
31. بررسی نقش long non-coding RNA ها در سرطان های انسانی با استفاده از بازسازی شبکه های هم بیانی ژن های کد کننده -غیر کد کننده
    شروین علایی 1396
32. الگوریتم های مختلف یافتن موتیف در شبکه های زیست شناسی
    زهرا رزاقی مقدم کاشانی 1396
33. بازسازی وآنالیز شبکه برهمکنشی دو بخشی miRNA و mRNA در مراحل مختلف سرطان روده بزرگ با رویکرد سیستم بیولوژی
    حبیب مطیع قادر 1396
34. مدلسازی مسیرهای متابولیکی سیانوباکتر با استفاده از رویکرد سیستم بیولوزی و سنتتیک بیولوژی به منظور تولید سوخت زیستی
    رضا محمدی 1396
35. آنالیز مقایسه ای در مقیاس ژنومی شبکه تظاهر ژنی سه ارگانیسم ساکن در ریه بیماران سیستیک فایبروزیس با استفاده از روش های سیستم بیولوژی
    نازنین حسین خان 1396
36. بهبود و پیشگویی ارتباطات در شبکه های زیستی با رویکردهای مبتنی بر پیشگویی پیوند
    صادق سلیمانی 1396
37. استنتاج ساختار شبکه های تنظیم ژنی با استفاده از روشهای یادگیری ماشین
    زهرا نریمانی 1396
38. مطالعه پاسخ دهی به درمان در سرطان با رویکرد سیستم بیولوژی
    زینب السادات موسویان حر 1396
39. بررسی تجربی و نظری اثر گلوکز و بوسولیک اسید بر روی مغز دیابتی موش در شرایط invivo,exvivo
    مرضیه دهقان شاسلطنه 1396
40. مدل سازی شبکه های متابولیک مخمر بر مبنای داده های اپی ژنیک
    علی صالح زاده یزدی 1396
41. بازسازی و شبیه سازی مسیر های مولکولی برهمکنشی در تغییر راه هوایی ریه با رویکرد سیستم بیولوژی
    علی نجفی 1396
42. پیشگویی شبکه بر هم کنش پروتئین ها به وسیله ترکیب طبقه بندها
    جواد ظهیری 1396
43. مدلسازی بیماری سرطان بعنوان یک بیماری متابولیکی
    یزدان عسگری 1396
44. مدلسازی دینامیک شبکه های پیام رسانی سلول با رویکرد سیستم بیولوژی
    ایثار نصیری 1396
45. مطالعه ژیشروی تومور با استفاده از سیستم بیولوزی
    غلامرضا بیدخوری 1396
46. ریز ریخت شناسی جنس افرا در ایران و کاربرد پردازش تصویر در تاکسونومی این جنس
    مژگان سادات محتشمیان 1396
47. ارائه نقشه ساختار -عملکرد مغز براساس رویکرد تبادل اطلاعات در بین شبکه ها : از ارتباطات تا شناخت
    حسین صیدخانی 1396
48. مطالعه فیزیولوژیکی بیوشیمیایی و ژنومیکی برخی آنزیمهای مسیر بیوسنتزی ترکیبات فنلی و اثر آنها در ریشه زایی برخی ارقام گردو
    منیره چنیانی 1396